江南受体研究揭示新冠中间宿主范围比SARS窄,穿山甲概率低—新闻—科学网

时间:2023-11-05 14:20:54 已阅读:77次

近几十年来,冠状病毒年夜风行已经对于全世界大众卫生组成伟大威逼。典型的例子是,SARS病毒于2003年致使非典年夜风行,SARS-CoV-2则致使了去年末以来的COVID-19年夜风行。两种病毒均被以为发源在蝙蝠,同时必需经由过程间接或者直接的种间流传,才气惹起年夜风行。

受体哄骗是决议病毒宿主规模的要害要素,而宿主规模又是病毒种间流传的要害。来自中国的最新研究以受体为切进口,发明新冠病毒中间宿主规模比SARS窄。鸡、小鼠几率低;而穿山甲一样几率不高,由于穿山甲冠状病毒对于ACE2的哄骗率更靠近SARS-CoV,而非SARS-CoV-2;三文鱼这种鱼类以及爬行类植物,则不成能是中间宿主。

近日,四川年夜学生物学院的研究团队于生物范畴预印本平台bioRxiv上揭晓了一篇论文,题为 Receptor utilization of angiotensin converting enzyme 2 (ACE2) indicates a narrower host range of SARS-CoV-2 than that of SARS-CoV 。该论文通信作者为四川年夜学生物学院病原生物学与免疫学研究所传授葛行义。

血管紧张素转换酶2 (ACE2)是SARS-CoV以及SARS-CoV-2的受体,但只要某些植物的ACE2可以被病毒哄骗。这项研究中,研究团队哄骗假病毒进入细胞试验来评估这两种病毒对于20种植物ACE2受体的哄骗威力。研究发明SARS-CoV-2比SARS-CoV使用的植物ACE2品种更少,注解SARS-CoV-2的宿主规模更窄。与此同时,另外一种SARS相干冠状病毒 穿山甲冠状病毒,其基因组与SARS-CoV-2高度同源,但其ACE2的哄骗环境与SARS-CoV相似,而非与SARS-CoV-2相似。

为了阐明受体哄骗机制,研究团队比力了20中植物ACE2的氨基酸序列,发明了5个可能对于ACE2哄骗至关主要的氨基酸残基,包孕可能决议SARS-CoV、SARS-CoV-2以及穿山甲冠状病毒差别受体哄骗的第20以及42个氨基酸N端。

研究者们提到,该研究促成了对于年夜风行冠状病毒受体哄骗的理解,可能有助在对于致病性冠状病毒的病毒追踪、中间宿主筛选以及疫情防控。

跨物种流传是致使高致病性冠状病毒风行的重要缘故原由,如SARS-CoV以及SARS-CoV-2。此前的病毒追踪研究注解,中华菊头蝠是SARS-CoV的自然宿主,近来的体系发育阐发显示,SARS-CoV-2可能也发源在蝙蝠相干SARS病毒。一些小型哺乳植物,假如子狸以及浣熊,多是SARS-CoV的中间宿主,并多是2003年头SARS风行的间接来历,由于这些植物体内可以或许乐成分散出SARS- CoV。一样,于马来穿山甲中也发明了近似SARS-CoV-2的病毒,这注解穿山甲也许是SARS-CoV-2的中间宿主。

中间宿自动物于自然病毒宿主向人类流传时阐扬主要作用,而病毒的宿主规模是决议中间宿主的主要要素。决议病毒宿主规模的一个重要要素是:病毒与宿主细胞上受体之间的辨认、联合。SARS-CoV以及SARS-CoV-2都哄骗血管紧张素转换酶2 (ACE2)作为细胞受体。

ACE2在2000年被发明,最初被以为一种表达在心脏以及肾脏血管内皮细胞的外肽酶,可催化血管紧张素的转化。ACE2高度守旧,于年夜大都脊椎植物中广泛表达,但其实不是所有的ACE2都能作为SARS-CoV以及SARS-CoV-2的受体。例如,SARS-CoV可使用小鼠的ACE2作为受体,而SARS-CoV-2不克不及,这注解小鼠是SARS-CoV的潜于宿主,而不是SARS-CoV-2的潜于宿主。

研究者以前的研究猜测了SARS-CoV-2对于ACE2的哄骗,注解SARS-CoV-2可以哄骗除了小鼠ACE2s以及部门鸟类ACE2s以外的年夜大都哺乳植物ACE2s。同时,研究者还猜测了ACE2中9个对于SARS-CoV-2哄骗至关主要的氨基酸残基。

于这项研究中,研究者于自然缺少ACE2表达的HeLa细胞中体外表达了20种差别植物的ACE2。然后用带有冠状病毒刺突卵白的假病毒颗粒传染细胞,检测其对于ACE2的哄骗。成果注解,SARS-CoV以及SARS-CoV-2均可以哄骗年夜大都哺乳植物的ACE2作为受体,而鱼类以及爬虫类则不克不及。

有趣的是,与小鼠ACE2相似,SARS-CoV可使用鸡的ACE2,而SARS-CoV-2不行,这注解SARS-CoV-2的宿主规模较窄,出格是于小鼠以及鸟类中。研究者还测试了穿山甲冠状病毒假病毒,其与SARS-CoV-2具备高度相似的刺突布局。令研究者惊奇的是,穿山甲冠状病毒的ACE2哄骗率与SARS-CoV相似,但与SARS-CoV-2其实不相似。

经由过程对于20个ACE2氨基酸序列比对于,研究者进一步确认了氨基酸残基T20、K3一、Q4二、Y83等对于SARS-CoV-2哄骗ACE2受体至关主要,而Y4一、K68等要害的氨基酸残基则不是。尤为是ACE2的T20氨基酸残基可能经由过程与S477以及T478于SARS-CoV-2 spike卵白的受体联合基序(RBM)内彼此作用,于刺突卵白-ACE2联合中阐扬了要害作用。但ACE2与SARS-CoV以及穿山甲冠状病毒刺突的联合其实不是必须的。这些氨基酸残基可能部门决议了SARS-CoV-2怪异的受体哄骗以及宿主规模。

综上所述,这项研究为SARS-CoV-2哄骗ACE2提供了更清楚的熟悉,这可能有助在更好地舆解病毒-受体彼此作用以及SARS-CoV-2的宿主规模。

假病毒制备以及ACE2表达的验证

于该研究中,研究者查询拜访了三种SARS相干病毒对于ACE2的哄骗,包孕SARS-CoV-BJ0一、SARS-CoV-2以及穿山甲冠状病毒。因为穿山甲被思疑是SARS-CoV-2的潜于中间宿主,研究者对于穿山甲冠状病毒举行了测试。值患上留意的是,除了了498个氨基酸残基外,穿山甲冠状病毒刺突卵白的受体联合基序(RBM)与SARS-CoV-2 刺突卵白险些不异,但于多个氨基酸位点上与SARS-CoV 冠状病毒差别。

为了验证三种假病毒制备乐成,取病毒后裂解用在病毒包装的HEK293T细胞,裂解细胞落伍行Western blot检测ha标志的刺突卵白。三种包装细胞的样品均显示出典型的SARS

相干刺突卵白条带(约180 kDa),申明假病毒制备乐成。

然后,研究者继承验证来自差别植物的20个ACE����APP2s于HeLa细胞中的表达。研究者用含有差别植物ACE2编码基因的质粒转染HeLa细胞。转染48 小时后可以不雅察到所有ACE2条带(约150 kDa),申明所有ACE2s于HeLa细胞中均乐成表达。

SARS-CoV以及SARS-CoV-2对于ACE2哄骗的差异

研究者别离用20个表达差别ACE2的质粒或者空载体转染HeLa细胞,作为比照。转染48小时后,细胞被SARS-CoV-BJ0一、SARS-CoV-2或者穿山甲冠状病毒假病毒传染。传染48小时后,裂解细胞并举行荧光素酶检测,以评估差别ACE2介导的伪病毒进入细胞的效率。

假如空载体转染并传染三种假病毒中的任一种的HeLa细胞的样品中均未不雅察到发光旌旗灯号,则申明没有ACE2的自然HeLa不克不及介导假病毒的进入。于表达甲壳类、鳄鱼或者蝰蛇ACE2的细胞的荧光旌旗灯号很低,这注解鱼以及爬行类ACE2险些不克不及介导假病毒的进入。当鸡或者小鼠表达ACE2的被SARS-CoV-BJ01假病毒传染而非SARS-CoV-2假病毒传染时,表达ACE2的细胞体现出较强的发光旌旗灯号,这申明SARS-CoV-BJ01可以哄骗鸡或者小鼠的ACE2进入细胞,而SARS-CoV-2不克不及。穿山甲冠状病毒对于鸡以及小鼠的ACE2均有益用威力,但其对于鸡ACE2的哄骗效率远低在SARS-CoV-BJ01。相反,于表达蝙蝠ACE2的细胞中,SARS-CoV-2伪病毒比SARS-CoV-BJ01或者穿山甲冠状病毒伪病毒引发的荧光更强,这注解SARS-CoV-2对于蝙蝠ACE2的哄骗威力最强。对于在其他的ACE2s,三种假病毒的传染都孕育发生了强的发光旌旗灯号,这申明三种SARSr-CoV都可以或许哄骗广泛的ACE2s。

SARS-CoV-2哄骗的ACE2s受体以及要害氨基酸的体系发育阐发

为了评价上述20个ACE2的体系发育瓜葛,研究团队基在所有ACE2的氨基酸序列构建了一个体系发育树。

他们不雅察到较着的哺乳植物、鸟类、爬虫类以及鱼类分支。而哺乳植物ACE2中,没有与SARS-CoV-BJ01或者SARS-CoV-2假病毒哄骗的ACE2相对于应的显著分支,这申明整个序列阐发很难展现病毒哄骗受体的要害要素。

于研究团队以前的研究中,基在SARS-CoV-2对于人、蝙蝠、果子狸、猪以及小鼠ACE2s的哄骗,他们猜测了人类ACE2上9个可能对于受体哄骗至关主要的氨基酸位点,包孕T20、K3一、Y4一、K6八、Y8三、K35三、D35五、R357以及M383。

于这项研究中,研究团队测试了别的15个物种,然后查抄了20个ACE2的9个位点,以验证这9个位点于SARS-CoV-2哄骗中的作用。

如图3A所示,Y/H4一、D35五、R357以及R383于所有ACE2s中守旧,申明这些位点其实不能决议SARS-CoV-2对于受体的哄骗。一样,K68于小鼠以及鸡的ACE2s中均生存,不克不及被SARS-CoV-2使用,可能对于SARS-CoV-2的哄骗也不主要。Q42于小鼠ACE2中守旧,于鸡ACE2中被E42替换,其于SARS-CoV-2中的作用可能繁杂。比拟之下,研究团队发明,可用ACE2s中的T20、K31以及Y83与不成用ACE2s中的氨基酸差别,申明它们于SARS-CoV-2哄骗方面起着决议性作用。

不外,研究团队一样提到研究尚有局限性,其重要基在氨基酸阐发,缺少试验证据,难以明确SARS-CoV-2的宿主规模。

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