江南研究人员完成燕麦基因组草图绘制—新闻—科学网
时间：2024-06-01 12:24:52 已阅读:77次
近日，中国科学院份子动物科学卓着立异中央、中国科学院 英国约翰英纳斯中央动物以及微生物科学结合研究中央韩斌院士团队与英国约翰英纳斯中央研究团队互助完成为了禾本科、燕麦属一年生草本动物二倍体燕麦Avena strigosa基因组序列草图的绘制，并完备地剖析了抗微生物防备化合物燕麦素的生物合成基因簇。5月7日，相干研究结果于线揭晓在《天然 通信》。
真核生物中非随机构造的基因于基因组进化以及功效中起着主要作用。绝年夜大都真核生物基因组中并无把持子，但它们又简直包罗了一些序列不相干而功效相干����APP而且于物理位置上成簇存于的基因。这些 类把持子 基因簇中，最惹人瞩目的例子就是动物体内合成非凡代谢产品的基因簇。已经有证据注解，这些cluster路子其实不是经由过程微生物程度基因转移而孕育发生，但今朝人们对于其真正的造成机制却知之甚少。燕麦素是燕麦属中特异存于的一类抗微生物防备化合物，其生物合成路子也是最典型的动物生物合成基因簇之一。 韩斌团队选用了能于根尖特异合成燕麦素的二倍体燕麦物种Avena strigosa，应用三代测序技能Nanopore并辅助光学图谱技能BioNano DLS，和Hi-C染色体构象捕捉技能乐成完成为了该燕麦基因组高品质染色体级别拆卸，拆卸基因组3.53Gb，scaffold N50高达73.4 Mb。燕麦基因组中反复序列约莫占基因组的81.1%，联合重新猜测、同源卵白信息和转录组数据共解释了34928 个高可托度基因。 这项研究基在拆卸得到的全基因组信息完备的剖析了燕麦素合成基因cluster，确定了燕麦素合成通路的末了两个缺掉步调，并经由过程本氏烟草瞬时表达重构了整个合成路子。同时，研究职员还对于基因簇的发源及差别燕麦种类间的差异举行了比力阐发。基因组拆卸以及DNA 荧光原位杂交（FISH）成果均注解，燕麦素合成基因cluster位在1号染色体长臂结尾的亚端粒区域，而且该基因簇特异存于在燕麦属中。 专家暗示，该研究事情为真核生物的基因组可塑性以及顺应性进化提供了新的见解，为改善小麦以及其他谷物抵挡全蚀病以及其他疾病提供了份子依据。 相干论文信息：https://www.nature.com/articles/s41467-021-22920-8 版权声明：凡本网注明 来历：中国科学报、科学网、科学新闻杂志 的所有作品，消息网转载，请于正文上方注明来历以及作者，且不患上对于内容作本色性改动；微信公家号、头条号等新媒体平台，转载请接洽授权。邮箱：shouquan@stimes.cn。/江南